A phylogenetic transform enhances analysis of compositional microbiota data
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
A phylogenetic transform enhances analysis of compositional microbiota data
Surveys of microbial communities (microbiota), typically measured as relative abundance of species, have illustrated the importance of these communities in human health and disease. Yet, statistical artifacts commonly plague the analysis of relative abundance data. Here, we introduce the PhILR transform, which incorporates microbial evolutionary models with the isometric log-ratio transform to ...
متن کاملPhylogenetic factorization of compositional data
1 Marker gene sequencing of microbial communities has generated big datasets 2 of microbial relative abundances varying across environmental conditions, sam3 ple sites and treatments. These data often come with putative phylogenies, 4 providing unique opportunities to investigate how shared evolutionary history 5 a ects microbial abundance patterns. Here, we present a method to identify the 6 p...
متن کاملSynchrosqueezing-based Transform and its Application in Seismic Data Analysis
Seismic waves are non-stationary due to its propagation through the earth. Time-frequency transforms are suitable tools for analyzing non-stationary seismic signals. Spectral decomposition can reveal the non-stationary characteristics which cannot be easily observed in the time or frequency representation alone. Various types of spectral decomposition methods have been introduced by some resear...
متن کاملa swot analysis of the english program of a bilingual school in iran
با توجه به جایگاه زبان انگلیسی به عنوان زبانی بین المللی و با در نظر گرفتن این واقعیت که دولت ها و مسئولان آموزش و پرورش در سراسر جهان در حال حاضر احساس نیاز به ایجاد موقعیتی برای کودکان جهت یاد گیری زبان انگلیسی درسنین پایین در مدارس دو زبانه می کنند، تحقیق حاضر با استفاده از مدل swot (قوت ها، ضعف ها، فرصتها و تهدیدها) سعی در ارزیابی مدرسه ای دو زبانه در ایران را دارد. جهت انجام این تحقیق در م...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: eLife
سال: 2017
ISSN: 2050-084X
DOI: 10.7554/elife.21887